Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cd28P31041 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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