Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms