Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa2P28309 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms