Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NdnP25233 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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NdnP25233 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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NdnP25233 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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NdnP25233 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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NdnP25233 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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NdnP25233 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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NdnP25233 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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NdnP25233 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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NdnP25233 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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NdnP25233 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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