Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Xrcc6P23475 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Xrcc6P23475 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Xrcc6P23475 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Xrcc6P23475 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Xrcc6P23475 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Xrcc6P23475 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Xrcc6P23475 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Xrcc6P23475 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc6P23475 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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