Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Eif3aP23116 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms