Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a2P20490 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms