Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ntf3P20181 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ntf3P20181 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms