Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PdgfaP20033 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PdgfaP20033 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PdgfaP20033 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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