Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhoP15409 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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RhoP15409 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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