Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Vpreb1P13372 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms