Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nr4a1P12813 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nr4a1P12813 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms