Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd4P10628 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms