Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P10404 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P10404 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P10404 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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