Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Spta1P08032 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Spta1P08032 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Spta1P08032 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms