Protein–RNA interactions for Protein: P01898

H2-Q10, H-2 class I histocompatibility antigen, Q10 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q10P01898 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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H2-Q10P01898 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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H2-Q10P01898 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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H2-Q10P01898 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-Q10P01898 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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H2-Q10P01898 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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H2-Q10P01898 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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H2-Q10P01898 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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H2-Q10P01898 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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H2-Q10P01898 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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H2-Q10P01898 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-Q10P01898 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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