Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01727 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01727 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01727 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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