Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01649 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01649 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01649 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms