Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01648 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01648 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01648 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01648 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01648 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01648 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01648 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01648 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01648 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01648 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01648 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01648 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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