Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccl20O89093 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccl20O89093 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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