Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sp1O89090 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sp1O89090 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms