Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops6O88545 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cops6O88545 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops6O88545 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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