Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AurkcO88445 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AurkcO88445 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms