Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms