Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Stra6O70491 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Stra6O70491 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Stra6O70491 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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