Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp4O70480 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp4O70480 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms