Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlkO54988 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SlkO54988 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlkO54988 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlkO54988 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlkO54988 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms