Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn5O54942 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn5O54942 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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