Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Kcns1O35173 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms