Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LhbO09108 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LhbO09108 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms