Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gcm2O09102 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms