Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22bO08547 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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