Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3278L7N2D2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3278L7N2D2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3278L7N2D2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3278L7N2D2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms