Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms