Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms