Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3336J3QMQ6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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