Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms