Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21244J3QK38 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21244J3QK38 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms