Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20830J3KML6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20830J3KML6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20830J3KML6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20830J3KML6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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