Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9yF8VPU6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9yF8VPU6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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