Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8220F6YKI2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms