Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm8247F6VRJ8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms