Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm3020E9Q3J7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm3020E9Q3J7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm3020E9Q3J7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm3020E9Q3J7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3020E9Q3J7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm3020E9Q3J7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm3020E9Q3J7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm3020E9Q3J7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm3020E9Q3J7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm3020E9Q3J7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm3020E9Q3J7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm3020E9Q3J7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm3020E9Q3J7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3020E9Q3J7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms