Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Susd1E9Q3H4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Susd1E9Q3H4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Susd1E9Q3H4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Susd1E9Q3H4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Susd1E9Q3H4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Susd1E9Q3H4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms