Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce3B5KM66 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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