Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Phf11bB4XVQ1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Phf11bB4XVQ1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Phf11bB4XVQ1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Phf11bB4XVQ1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Phf11bB4XVQ1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Phf11bB4XVQ1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms