Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp26c1B2RXA7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms