Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clrn2B2RVW2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms