Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Usf3B2RUQ2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms