Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prrt4B2RU40 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prrt4B2RU40 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms